1966年“运动”开始后，总政治部主任萧华遭遇冲击，缘由在于他得罪了江青与叶群。

抗战时，萧华在山东得知江青品行不佳，虽崇敬毛泽东，但与她保持距离。江青想兼职总政，萧华未允。50年代后，萧华得知叶群作风问题，成为其心病。后两人联手报复。

1966年8月，江青送萧华简报，称其子在银川杀人，并附批语“王子犯法，与庶民同罪”。萧华见后觉荒谬，注明儿子在清华未离身，随即遣人归还简报于江青。

1966年11月，军事院校频发造反事件。萧华为稳部队，请示叶剑英后决定召开来京学员大会。虽贺龙已受冲击，但萧华认为他仍是军委副主席，应请其出席会议。

贺龙最终出席了大会，江青见到他后勃然大怒，斥责萧华道：“你们让贺龙出场亮相，这是公然向中央挑战示威！”

1967年1月初，刘志坚被“打倒”。1月19日，中央军委碰头会上，江青诬蔑萧华为刘志坚后台，指责萧华在执行中央文化革命指示时敷衍了事。

陈伯达继续道：“萧华近乎将人民解放军引向资产阶级军队之路，他自身更像位绅士，而非战士所具备的特质。”

萧华终无法忍受，起身道：“我尚能发言否？可否让我说几句？我12岁投身革命，受毛主席指引。我从未反对过他。工作有误可指，但称我为‘三反分子’绝不可！”

江青未料萧华竟公然反驳，顿时怒不可遏，拍桌怒斥：“有种你就到二十万人的大会上去说！”

晚上8点半应是萧华批斗会时间，但他9点在家仍未见开始。原来，会议结束后，叶剑英与聂荣臻向周恩来汇报，周听后愤怒表示：萧华跟随毛主席多年，怎会反对他及毛泽东思想？

周恩来向毛泽东汇报了情况，毛泽东愤怒地指示：“如此大事为何不上报？立刻阻止，总政主任怎能随意批评？”

1967年3月3日，为确保萧华安全及总政治部运作，周恩来在人民大会堂面对6000余名总政治部人员及三军红卫兵代表，亲自发言数小时力保萧华，言辞恳切动人。

同志们，你们反对萧华，可真正了解他吗？他12岁投身革命，13岁任县青年团书记，受毛主席亲授教育，步步成长于党。17岁任少共国际师政委，长征时已18岁。

我目睹萧华成长，他对毛主席情感深厚，方能创作《长征组歌》。萧华兼具军事才能、政治经验和文学素养，试问谁能写出此作？我自愧不如。

我反复观看了《长征组歌》17次，尤其钟爱“毛主席用兵真如神”这句。提及“运动”，不应全盘否定老干部，如萧华等若被打倒，总政治部崩溃，后果堪忧。

这番深情的话语，让许多人动容落泪，有人当场说：“我们曾误解萧华，如今明白他的为人，之前反对是错了，以后不会再反对。”

周恩来力挽狂澜的讲话，让萧华与总政治部党委重振旗鼓。但林彪、江青等人仍不罢休，1968年1月萧华遭秘密囚禁，于5平米小屋度过了6年，生活费每月仅8元。

1973年，王新兰因久无萧华音讯，心脏病发入院，遂致信周恩来求见。周迅速批复，不久，王新兰携子女在会议室与五年未见的萧华重逢。

萧华神情呆滞，见到家人后眼中闪过一丝惊异，随即恢复常态。孩子们见父亲如此，忍不住哭泣。王新兰背身默泪。专案组在场，一家沉默，气氛压抑，萧华安慰家人：“我没事，别担心。”

萧云扶父上厕所时，借机展示手心写的“林彪死了”，萧华一愣，眼神闪烁。告别时，他对王新兰说：“新兰，你要多保重。”王新兰闻言，泪水如泉涌般滑落。

1974年9月，建国25周年纪念日将至，“四人帮”提交天安门国庆观礼名单给毛泽东审批。名单能否上榜，在当时被视为政治待遇及“解放”象征。毛泽东沉思后增添萧华与刘志坚，迫使“四人帮”紧急释放萧华。

萧华获释通知后，表现得格外冷静。他对专案组言道：“昔日何故拘我？今又何故释我？望予书面结论。”

专案组别无他法，遂请王新兰劝说萧华出面。王新兰对萧华道：“既然毛主席让我们归家，那便回去，是非难辨，况且孩子们正盼着你呢！”

萧华听闻后愣了许久，最终长长地叹了口气，无奈应允道：“唉，就这样吧！”

9月30日，萧华现身国庆招待会，周恩来深情地紧握其手，长时间未言一语，心中感慨难以言表。

萧华获释后，朱德邀其至家中。见萧华历经艰辛，朱德宽慰道：“你还年轻，部队生涯长着呢。要振作，党员受委屈正常。战争年代更苦，我们都挺过来了，这点挫折怎能灰心？”

萧华听后深受感动，决心振作。朱德关切地询问：“萧华，家中是否还存有书籍？”

萧华摇头道：“我家已被那些人抄了3次，现在什么都没剩下，全都被他们抄走了。”

朱德随即拉开书柜，精心挑选出一本马恩列斯及毛泽东哲学著作选集赠予萧华，并深情叮嘱道：

违背唯物辩证法的事物，尽管眼前可能盛行，但从长远看，终将在历史上失去立足之地。因此，我们必须认真学习它，作为辨别真假马列主义的锐利武器。

晚年回忆此事，萧华动容道：“他如同慈父，洞悉子女心意，赠我诸多肺腑良言……”

1975年7月，萧华出任军事科学院第二政委一职，满怀激情地踏上了新的工作旅程，准备迎接新的挑战与任务。